巧克力2號店搭配的教學活動涵蓋文本閱讀、情境體驗、圖像設計、角色扮演，內容豐富，讓慈大附中的老師特地安排三堂課來操作。老師首先結合「你是戒嚴時代的誰」及「轉型正義資料庫」，帶學生貼近戒嚴時代的社會氛圍、認知到這些政治案件真實發生過。
老師接著依照示範教案，操作巧克力2號店。老師曾操作兩次，第一次是連續操作三節課，由於時間長且連續，學生比較能投入課程情境；第二次則分成不連續的三節課操作，學生可以運用課餘時間完成巧克力包裝設計。老師分享，巧克力2號店讓學生有機會以書寫、圖像設計、口語表達表達，讓她看見擅長不同能力的學生在課堂上都能有各自的發揮空間。最後，老師提問「你有聽過不義遺址嗎？如果沒有，為什麼這麼少人聽過？」，並邀請學生討論可以展開什麼樣的行動。